El compositor explica esta partitura del Sanctus con las siguientes palabras:

El Sanctus, cuyo texto aclama Santo, Santo, Santo es el Señor Dios del universo…. Es una proclamación de la santidad de Dios y de su gloria. Presenta un carácter más solemne con momentos de expansión. La música pretende evocar lo celestial y lo trascendente de forma que potencie una atmósfera de adoración profunda.

La tonalidad vuelve a ser la de Re menor, la cual ayuda a recuperar un mayor recogimiento tras el Gloria y el Alleluia que habían tenido un carácter más vivo y brillante. El empleo de nuevo la cadencia andaluza en el incio – ya usada en el Gloria y que volverá a repetirse en el Agnus Dei – potencia la unidad y el carácter musical de la Misa.